Kirk právě dost neúspěšně vyjednává s Halkanany o těžbě dilithiových krystalů na jejich planetě, když jsou přerušeni iontovou bouří. Rychle jsou transportováni na palubu, ale bouře, jak se zdá, zasáhla i loď. Když se Kirk, McCoy, Scotty a Uhura materializují, objeví se sice na Enterprise, ale v alternativním vesmíru. Zde místo Federace existuje Říše, která je udržována strachem a vraždy jsou na denním pořádku. "Hodný" Kirk s ostatními musí najít způsob, jak na palubě imperiální lodi Enterprise zůstat neodhaleni a jak se vrátit do svého vesmíru. To jim ale stěžuje nejen podezřívavý Spock, ale i posádka Enterprise, která vidí příležitost, jak se svého kapitána zbavit. Mezitím se alternativní zlotřilé verze Kirka, McCoye, Scottyho a Uhury ocitají na palubě U.S.S. Enterprise...